與 SAS 比較#

對於來自 SAS 的潛在使用者,此頁面旨在說明在 pandas 中如何執行不同的 SAS 作業。

如果您是 pandas 新手,您可能想要先閱讀 10 分鐘學會 pandas,以熟悉此函式庫。

根據慣例,我們匯入 pandas 和 NumPy,如下所示

In [1]: import pandas as pd

In [2]: import numpy as np

資料結構#

一般術語翻譯#

pandas

SAS

DataFrame

資料集

變數

觀測值

groupby

BY 群組

NaN

.

DataFrame#

pandas 中的 DataFrame 類似於 SAS 資料集,是一個具有標籤欄的二維資料來源,欄位可以是不同的類型。正如本文檔中所示,幾乎任何可以使用 SAS 的 DATA 步驟套用於資料集的作業,也可以在 pandas 中完成。

Series#

一個 Series 是代表 DataFrame 一欄的資料結構。SAS 沒有單一欄位個別的資料結構,但一般來說,使用 Series 類似於在 DATA 步驟中參照 DataFrame 中的欄位。

Index#

每個 DataFrameSeries 都有 Index - 這是資料的標籤。SAS 沒有完全類似的概念。資料集的列基本上沒有標籤,除了隱含的整數索引,可以在 DATA 步驟中存取 (_N_)。

在 pandas 中,如果沒有指定索引,預設也會使用整數索引(第一列 = 0,第二列 = 1,以此類推)。使用標籤的 IndexMultiIndex 可以進行複雜的分析,而且最終是了解 pandas 的重要部分,但針對此比較,我們基本上會忽略 Index,並將 DataFrame 視為欄位的集合。請參閱 索引文件,以進一步了解如何有效使用 Index

複製與原地操作#

大多數的 pandas 操作會傳回 Series/DataFrame 的副本。若要讓變更「生效」,您需要指派給新變數

sorted_df = df.sort_values("col1")

或覆寫原始變數

df = df.sort_values("col1")

注意

您會看到 inplace=Truecopy=False 關鍵字參數可用於某些方法

df.replace(5, inplace=True)

有一個積極的討論,關於棄用並移除 inplacecopy 對於大多數的方法(例如 dropna),除了少數的方法(包括 replace)。在寫入時複製語境中,兩個關鍵字都不再必要。提案可以在 這裡 找到。

資料輸入/輸出#

從值建立 DataFrame#

SAS 資料集可以透過在 datalines 陳述式後放置資料並指定欄位名稱來建立。

data df;
    input x y;
    datalines;
    1 2
    3 4
    5 6
    ;
run;

pandas DataFrame 可以用許多不同的方式建立,但對於少數值,通常方便將其指定為 Python 字典,其中鍵是欄位名稱,而值是資料。

In [1]: df = pd.DataFrame({"x": [1, 3, 5], "y": [2, 4, 6]})

In [2]: df
Out[2]: 
   x  y
0  1  2
1  3  4
2  5  6

讀取外部資料#

與 SAS 類似,pandas 提供了從許多格式讀取資料的公用程式。tips 資料集位於 pandas 測試中 (csv),將會用於許多以下範例。

SAS 提供 PROC IMPORT 來將 csv 資料讀取到資料集中。

proc import datafile='tips.csv' dbms=csv out=tips replace;
    getnames=yes;
run;

pandas 方法是 read_csv(),其運作方式類似。

In [3]: url = (
   ...:     "https://raw.githubusercontent.com/pandas-dev/"
   ...:     "pandas/main/pandas/tests/io/data/csv/tips.csv"
   ...: )
   ...: 

In [4]: tips = pd.read_csv(url)

In [5]: tips
Out[5]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         16.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1         10.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         21.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         23.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         24.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       29.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       27.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       22.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       17.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       18.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

PROC IMPORT 類似,read_csv 可以採用許多參數來指定資料的剖析方式。例如,如果資料改為以 tab 分隔,且沒有欄位名稱,pandas 指令會是

tips = pd.read_csv("tips.csv", sep="\t", header=None)

# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimiter
tips = pd.read_table("tips.csv", header=None)

除了文字/csv 之外,pandas 還支援各種其他資料格式,例如 Excel、HDF5 和 SQL 資料庫。這些全部都透過 pd.read_* 函數來讀取。請參閱 IO 文件 以取得更多詳細資料。

限制輸出#

預設情況下,pandas 會將大型 DataFrame 的輸出截斷,以顯示第一行和最後一行。這可以用 變更 pandas 選項,或使用 DataFrame.head()DataFrame.tail() 來覆寫。

In [1]: tips.head(5)
Out[1]: 
   total_bill   tip     sex smoker  day    time  size
0       16.99  1.01  Female     No  Sun  Dinner     2
1       10.34  1.66    Male     No  Sun  Dinner     3
2       21.01  3.50    Male     No  Sun  Dinner     3
3       23.68  3.31    Male     No  Sun  Dinner     2
4       24.59  3.61  Female     No  Sun  Dinner     4

SAS 中的等效方式為

proc print data=df(obs=5);
run;

匯出資料#

SAS 中 PROC IMPORT 的反向操作是 PROC EXPORT

proc export data=tips outfile='tips2.csv' dbms=csv;
run;

類似地,在 pandas 中,read_csv 的反向操作是 to_csv(),其他資料格式遵循類似的 API。

tips.to_csv("tips2.csv")

資料運算#

欄位運算#

DATA 步驟中,可以在新的或現有的欄位上使用任意數學運算式。

data tips;
    set tips;
    total_bill = total_bill - 2;
    new_bill = total_bill / 2;
run;

pandas 透過在 DataFrame 中指定個別 Series 來提供向量化操作。新欄位也可以用相同方式指定。 DataFrame.drop() 方法會從 DataFrame 中刪除一個欄位。

In [1]: tips["total_bill"] = tips["total_bill"] - 2

In [2]: tips["new_bill"] = tips["total_bill"] / 2

In [3]: tips
Out[3]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size  new_bill
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2     7.495
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3     4.170
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3     9.505
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2    10.840
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4    11.295
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...       ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3    13.515
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2    12.590
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2    10.335
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2     7.910
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2     8.390

[244 rows x 8 columns]

In [4]: tips = tips.drop("new_bill", axis=1)

篩選#

SAS 中的篩選是使用 ifwhere 陳述式,針對一個或多個欄位。

data tips;
    set tips;
    if total_bill > 10;
run;

data tips;
    set tips;
    where total_bill > 10;
    /* equivalent in this case - where happens before the
       DATA step begins and can also be used in PROC statements */
run;

資料框可以用多種方式篩選;最直覺的方式是使用 布林索引

In [1]: tips[tips["total_bill"] > 10]
Out[1]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
5         23.29  4.71    Male     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[204 rows x 7 columns]

上述陳述式只是將 SeriesTrue/False 物件傳遞到資料框,傳回所有具有 True 的列。

In [2]: is_dinner = tips["time"] == "Dinner"

In [3]: is_dinner
Out[3]: 
0      True
1      True
2      True
3      True
4      True
       ... 
239    True
240    True
241    True
242    True
243    True
Name: time, Length: 244, dtype: bool

In [4]: is_dinner.value_counts()
Out[4]: 
time
True     176
False     68
Name: count, dtype: int64

In [5]: tips[is_dinner]
Out[5]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[176 rows x 7 columns]

如果/然後邏輯#

在 SAS 中,如果/然後邏輯可以用來建立新欄位。

data tips;
    set tips;
    format bucket $4.;

    if total_bill < 10 then bucket = 'low';
    else bucket = 'high';
run;

在 pandas 中,可以使用 numpywhere 方法來執行相同的操作。

In [1]: tips["bucket"] = np.where(tips["total_bill"] < 10, "low", "high")

In [2]: tips
Out[2]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size bucket
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2   high
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3    low
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3   high
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2   high
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4   high
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...    ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3   high
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2   high
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2   high
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2   high
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2   high

[244 rows x 8 columns]

日期功能#

SAS 提供各種功能來對日期/日期時間欄位執行操作。

data tips;
    set tips;
    format date1 date2 date1_plusmonth mmddyy10.;
    date1 = mdy(1, 15, 2013);
    date2 = mdy(2, 15, 2015);
    date1_year = year(date1);
    date2_month = month(date2);
    * shift date to beginning of next interval;
    date1_next = intnx('MONTH', date1, 1);
    * count intervals between dates;
    months_between = intck('MONTH', date1, date2);
run;

等效的 pandas 操作如下所示。除了這些功能外,pandas 還支援 Base SAS 中沒有的其他時間序列功能(例如重新取樣和自訂偏移)-請參閱 時間序列文件 以取得更多詳細資料。

In [1]: tips["date1"] = pd.Timestamp("2013-01-15")

In [2]: tips["date2"] = pd.Timestamp("2015-02-15")

In [3]: tips["date1_year"] = tips["date1"].dt.year

In [4]: tips["date2_month"] = tips["date2"].dt.month

In [5]: tips["date1_next"] = tips["date1"] + pd.offsets.MonthBegin()

In [6]: tips["months_between"] = tips["date2"].dt.to_period("M") - tips[
   ...:     "date1"
   ...: ].dt.to_period("M")
   ...: 

In [7]: tips[
   ...:     ["date1", "date2", "date1_year", "date2_month", "date1_next", "months_between"]
   ...: ]
   ...: 
Out[7]: 
         date1      date2  date1_year  date2_month date1_next    months_between
0   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
1   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
2   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
3   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
4   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
..         ...        ...         ...          ...        ...               ...
239 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
240 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
241 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
242 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
243 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>

[244 rows x 6 columns]

欄位選取#

SAS 在 DATA 步驟中提供關鍵字來選取、刪除和重新命名欄位。

data tips;
    set tips;
    keep sex total_bill tip;
run;

data tips;
    set tips;
    drop sex;
run;

data tips;
    set tips;
    rename total_bill=total_bill_2;
run;

以下用 pandas 表達相同的操作。

保留特定欄位#

In [1]: tips[["sex", "total_bill", "tip"]]
Out[1]: 
        sex  total_bill   tip
0    Female       14.99  1.01
1      Male        8.34  1.66
2      Male       19.01  3.50
3      Male       21.68  3.31
4    Female       22.59  3.61
..      ...         ...   ...
239    Male       27.03  5.92
240  Female       25.18  2.00
241    Male       20.67  2.00
242    Male       15.82  1.75
243  Female       16.78  3.00

[244 rows x 3 columns]

刪除欄位#

In [2]: tips.drop("sex", axis=1)
Out[2]: 
     total_bill   tip smoker   day    time  size
0         14.99  1.01     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 6 columns]

重新命名欄位#

In [3]: tips.rename(columns={"total_bill": "total_bill_2"})
Out[3]: 
     total_bill_2   tip     sex smoker   day    time  size
0           14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1            8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2           19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3           21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4           22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..            ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239         27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240         25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241         20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242         15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243         16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

依據數值排序#

SAS 中的排序透過 PROC SORT 完成

proc sort data=tips;
    by sex total_bill;
run;

pandas 有 DataFrame.sort_values() 方法,它會採用一串欄位來排序。

In [1]: tips = tips.sort_values(["sex", "total_bill"])

In [2]: tips
Out[2]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3

[244 rows x 7 columns]

字串處理#

尋找字串長度#

SAS 使用 LENGTHNLENGTHC 函數來決定字元字串的長度。 LENGTHN 排除尾空白,而 LENGTHC 包含尾空白。

data _null_;
set tips;
put(LENGTHN(time));
put(LENGTHC(time));
run;

你可以使用 Series.str.len() 來找出字串的長度。在 Python 3 中,所有字串都是 Unicode 字串。 len 包含尾隨空白。使用 lenrstrip 來排除尾隨空白。

In [1]: tips["time"].str.len()
Out[1]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

In [2]: tips["time"].str.rstrip().str.len()
Out[2]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

尋找子字串的位置#

SAS 使用 FINDW 函數來判斷字串中字元的位子。 FINDW 函數會使用第一個參數所定義的字串,並搜尋你提供在第二個參數中的子字串的第一個位子。

data _null_;
set tips;
put(FINDW(sex,'ale'));
run;

你可以使用 Series.str.find() 方法來找出字串欄位中字元的位子。 find 會搜尋子字串的第一個位子。如果找到子字串,此方法會傳回它的位子。如果找不到,它會傳回 -1。請記住 Python 的索引值從 0 開始。

In [1]: tips["sex"].str.find("ale")
Out[1]: 
67     3
92     3
111    3
145    3
135    3
      ..
182    1
156    1
59     1
212    1
170    1
Name: sex, Length: 244, dtype: int64

根據位置擷取子字串#

SAS 使用 SUBSTR 函數根據字串中的位置來擷取子字串。

data _null_;
set tips;
put(substr(sex,1,1));
run;

在 pandas 中,你可以使用 [] 符號來根據位置從字串中擷取子字串。請記住 Python 的索引值從 0 開始。

In [1]: tips["sex"].str[0:1]
Out[1]: 
67     F
92     F
111    F
145    F
135    F
      ..
182    M
156    M
59     M
212    M
170    M
Name: sex, Length: 244, dtype: object

擷取第 n 個字#

SAS SCAN 函數傳回字串中的第 n 個字。第一個參數是要剖析的字串,第二個參數則指定要萃取的字。

data firstlast;
input String $60.;
First_Name = scan(string, 1);
Last_Name = scan(string, -1);
datalines2;
John Smith;
Jane Cook;
;;;
run;

在 pandas 中萃取字詞最簡單的方法是依空白鍵分割字串,然後依索引參照字詞。請注意,如有需要,還有更強大的方法。

In [1]: firstlast = pd.DataFrame({"String": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [2]: firstlast["First_Name"] = firstlast["String"].str.split(" ", expand=True)[0]

In [3]: firstlast["Last_Name"] = firstlast["String"].str.rsplit(" ", expand=True)[1]

In [4]: firstlast
Out[4]: 
       String First_Name Last_Name
0  John Smith       John     Smith
1   Jane Cook       Jane      Cook

變更大小寫#

SAS UPCASE LOWCASEPROPCASE 函數會變更參數的大小寫。

data firstlast;
input String $60.;
string_up = UPCASE(string);
string_low = LOWCASE(string);
string_prop = PROPCASE(string);
datalines2;
John Smith;
Jane Cook;
;;;
run;

等效的 pandas 方法為 Series.str.upper()Series.str.lower()Series.str.title()

In [1]: firstlast = pd.DataFrame({"string": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [2]: firstlast["upper"] = firstlast["string"].str.upper()

In [3]: firstlast["lower"] = firstlast["string"].str.lower()

In [4]: firstlast["title"] = firstlast["string"].str.title()

In [5]: firstlast
Out[5]: 
       string       upper       lower       title
0  John Smith  JOHN SMITH  john smith  John Smith
1   Jane Cook   JANE COOK   jane cook   Jane Cook

合併#

合併範例中將使用下列表格

In [1]: df1 = pd.DataFrame({"key": ["A", "B", "C", "D"], "value": np.random.randn(4)})

In [2]: df1
Out[2]: 
  key     value
0   A  0.469112
1   B -0.282863
2   C -1.509059
3   D -1.135632

In [3]: df2 = pd.DataFrame({"key": ["B", "D", "D", "E"], "value": np.random.randn(4)})

In [4]: df2
Out[4]: 
  key     value
0   B  1.212112
1   D -0.173215
2   D  0.119209
3   E -1.044236

在 SAS 中,資料必須在合併之前明確排序。使用 in= 虛擬變數來追蹤在一個或兩個輸入框架中是否找到配對,以達成不同類型的聯結。

proc sort data=df1;
    by key;
run;

proc sort data=df2;
    by key;
run;

data left_join inner_join right_join outer_join;
    merge df1(in=a) df2(in=b);

    if a and b then output inner_join;
    if a then output left_join;
    if b then output right_join;
    if a or b then output outer_join;
run;

pandas DataFrames 有一個 merge() 方法,它提供類似的功能。資料不必事先排序,而且不同的連接類型是透過 how 關鍵字來完成。

In [1]: inner_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="inner")

In [2]: inner_join
Out[2]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209

In [3]: left_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="left")

In [4]: left_join
Out[4]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

In [5]: right_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="right")

In [6]: right_join
Out[6]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209
3   E       NaN -1.044236

In [7]: outer_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="outer")

In [8]: outer_join
Out[8]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

遺失資料#

pandas 和 SAS 都有遺失資料的表示方式。

pandas 使用特殊浮點值 NaN(不是數字)來表示遺失資料。許多語意是相同的;例如,遺失資料會傳播到數值運算中,而且在聚合時預設會忽略它。

In [1]: outer_join
Out[1]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

In [2]: outer_join["value_x"] + outer_join["value_y"]
Out[2]: 
0         NaN
1    0.929249
2         NaN
3   -1.308847
4   -1.016424
5         NaN
dtype: float64

In [3]: outer_join["value_x"].sum()
Out[3]: -3.5940742896293765

一個不同點是遺失資料無法與其哨兵值相比較。例如,在 SAS 中,您可以這樣做來篩選遺失值。

data outer_join_nulls;
    set outer_join;
    if value_x = .;
run;

data outer_join_no_nulls;
    set outer_join;
    if value_x ^= .;
run;

在 pandas 中,Series.isna()Series.notna() 可用於篩選列。

In [1]: outer_join[outer_join["value_x"].isna()]
Out[1]: 
  key  value_x   value_y
5   E      NaN -1.044236

In [2]: outer_join[outer_join["value_x"].notna()]
Out[2]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

pandas 提供 各種方法來處理遺失資料。以下是一些範例

刪除有遺失值的列#

In [3]: outer_join.dropna()
Out[3]: 
  key   value_x   value_y
1   B -0.282863  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

從前一列向前填入#

In [4]: outer_join.ffill()
Out[4]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E -1.135632 -1.044236

以指定值取代遺失值#

使用平均值

In [5]: outer_join["value_x"].fillna(outer_join["value_x"].mean())
Out[5]: 
0    0.469112
1   -0.282863
2   -1.509059
3   -1.135632
4   -1.135632
5   -0.718815
Name: value_x, dtype: float64

GroupBy#

聚合#

SAS 的 PROC SUMMARY 可用於依一個或多個關鍵變數進行分組,並對數字欄位計算聚合。

proc summary data=tips nway;
    class sex smoker;
    var total_bill tip;
    output out=tips_summed sum=;
run;

pandas 提供一個彈性的 groupby 機制,允許類似的聚合。請參閱 groupby 文件 以取得更多詳細資料和範例。

In [1]: tips_summed = tips.groupby(["sex", "smoker"])[["total_bill", "tip"]].sum()

In [2]: tips_summed
Out[2]: 
               total_bill     tip
sex    smoker                    
Female No          869.68  149.77
       Yes         527.27   96.74
Male   No         1725.75  302.00
       Yes        1217.07  183.07

轉換#

在 SAS 中,如果群組聚合需要與原始框架一起使用,則必須將其合併回來。例如,依據吸菸者群組減去每個觀察值的平均值。

proc summary data=tips missing nway;
    class smoker;
    var total_bill;
    output out=smoker_means mean(total_bill)=group_bill;
run;

proc sort data=tips;
    by smoker;
run;

data tips;
    merge tips(in=a) smoker_means(in=b);
    by smoker;
    adj_total_bill = total_bill - group_bill;
    if a and b;
run;

pandas 提供一個 轉換 機制,允許這些類型的運算在一個運算中簡潔地表達。

In [1]: gb = tips.groupby("smoker")["total_bill"]

In [2]: tips["adj_total_bill"] = tips["total_bill"] - gb.transform("mean")

In [3]: tips
Out[3]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size  adj_total_bill
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1      -17.686344
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2      -15.006344
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1      -11.938278
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.838278
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.678278
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...             ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3       24.593656
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6       28.981722
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4       29.081722
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4       29.141722
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3       30.053656

[244 rows x 8 columns]

依群組處理#

除了聚合之外,pandas groupby 可用於複製 SAS 中大多數其他依群組處理。例如,此 DATA 步驟依性別/吸菸者群組讀取資料,並篩選到每個群組的第一個輸入。

proc sort data=tips;
   by sex smoker;
run;

data tips_first;
    set tips;
    by sex smoker;
    if FIRST.sex or FIRST.smoker then output;
run;

在 pandas 中,這會寫成

In [4]: tips.groupby(["sex", "smoker"]).first()
Out[4]: 
               total_bill   tip   day    time  size  adj_total_bill
sex    smoker                                                      
Female No            5.25  1.00   Sat  Dinner     1      -11.938278
       Yes           1.07  1.00   Sat  Dinner     1      -17.686344
Male   No            5.51  2.00  Thur   Lunch     2      -11.678278
       Yes           5.25  5.15   Sun  Dinner     2      -13.506344

其他考量#

磁碟與記憶體#

pandas 僅在記憶體中運作,而 SAS 資料集存在於磁碟上。這表示能夠載入 pandas 的資料大小受到電腦記憶體的限制,但對該資料執行的運算可能會更快。

如果需要核心外處理,一種可能性是 dask.dataframe 函式庫(目前正在開發中),它提供了一個 DataFrame 針對磁碟的 pandas 功能子集

資料互通#

pandas 提供了一個 read_sas() 方法,可以讀取儲存在 XPORT 或 SAS7BDAT 二進位格式的 SAS 資料。

libname xportout xport 'transport-file.xpt';
data xportout.tips;
    set tips(rename=(total_bill=tbill));
    * xport variable names limited to 6 characters;
run;
df = pd.read_sas("transport-file.xpt")
df = pd.read_sas("binary-file.sas7bdat")

您也可以直接指定檔案格式。預設情況下,pandas 會根據其副檔名推斷檔案格式。

df = pd.read_sas("transport-file.xpt", format="xport")
df = pd.read_sas("binary-file.sas7bdat", format="sas7bdat")

XPORT 是一個相對有限的格式,其解析並未像其他一些 pandas 讀取器那樣經過最佳化。在 SAS 和 pandas 之間互通資料的另一種方法是序列化為 csv。

# version 0.17, 10M rows

In [8]: %time df = pd.read_sas('big.xpt')
Wall time: 14.6 s

In [9]: %time df = pd.read_csv('big.csv')
Wall time: 4.86 s